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1回の実験で30種類のヒト免疫マーカーの発現を確認
BD® OMICS-One Immune Profiler Protein Panel (BD® OMICS-One IP Protein Panel) は、BDの抗体オリゴベースの技術を使用して開発されており、主要なヒト免疫マーカーに対する30種類の異なる特異抗体が凍結乾燥されて1本のチューブに含まれています。
BD® OMICS-One IP Protein Panelは、BD Rhapsodyシングルセル解析システムを用いたCITE-seq研究に最適化されており、BD Rhapsody Single™-Cell RNA AssaysおよびBD® Single-Cell Multiplexing Kitsを組み合わせたシームレスな研究を実現します。
詳細については、 BD® OMICS-One Immune Profiler Protein Panel brochure のカタログをご覧ください。



BD® OMICS-One Immune Profiler Protein Panel 特異性リスト
30 pre-titrated antibodies
Specificity | Clone |
---|---|
CD3 | UCHT1 |
CD4 | SK3 |
CD8 | SK1 |
CD11c | B-Ly6 |
CD14 | MΦP9 |
CD16 | 3G8 |
CD19 | SJ25C1 |
CD25 | 2A3 |
CD27 | M-T271 |
CD28 | L293 |
Specificity | Clone |
---|---|
CD45RA | HI100 |
CD56 | NCAM16 |
CD62L | DREG-56 |
CD127 | HIL-7R-M21 |
CD134 | ACT35 |
CD137 | 4B4-1 |
CD161 | HP-3G10 |
CD183 (CXCR3) | 1C6/CXCR3 |
CD185 (CXCR5) | RF8B2 |
CD186 (CXCR6) | 13B 1E5 |
Specificity | Clone |
---|---|
CD196 (CCR6) | 11A9 |
CD197 (CCR7) | 2-L1-A |
CD272 | J168-540 |
CD278 | DX29 |
CD279 | EH12.1 |
CD357 (GITR) | V27-580 |
CD366 (TIM-3) | 7D3 |
HLA-DR | G46-6 |
IgD | IA6-2 |
IgM | G20-127 |
Performance
BD® OMICS-One IP タンパク質パネルと、新しく混合した BD® AbSeq 抗体のパフォーマンスは同様です。全血から分離した後、末梢血単核細胞 (PBMC) を休止 (未処理) グループと活性化 (CD3/CD28 で 24 時間処理) グループに分けました。休止細胞と活性化細胞の 1:1 混合物を、BD® OMICS-One IP タンパク質パネルまたは同じ AbSeq 特異性の新しく調製した混合物で染色しました。次に、同数の細胞を BD Rhapsody™ カートリッジにロードし、AbSeq および WTA ライブラリを生成してシーケンスしました (この研究では n = 2 の個別実験)。データは SeqGeq™ ソフトウェアを使用して分析しました。


BD® OMICS-One IP タンパク質パネルに含まれる 30 種類の AbSeq 特異性すべてのパフォーマンス。PBMC は、上の図で説明されているように活性化され、準備されました。染色後、細胞は BD Rhapsody™ システムでキャプチャされ、AbSeq および WTA ライブラリが生成され、シーケンスされました。80% を超えるシーケンス飽和度を得るために、ライブラリは、Illumina™ NextSeq™ High-Output Kit を使用して、WTA の場合は 20,000 読み取り/セル、AbSeq の場合は 30,000 読み取り/セルでシーケンスされました。データは、SeqGeq™ ソフトウェアを使用して分析されました。上記の実験を少なくとも 2 人の異なるドナーで繰り返しました。1 人のドナーからの代表的な図がここに示されています。
A. BD® OMICS-One IP タンパク質パネル抗体と WTA mRNA プロファイルによって解決された休止状態 + 活性化 PBMCs の UMAP の細胞注釈。
B. (A) BD® OMICS-One IP タンパク質パネルからの各 AbSeq クローンの UMAP 上のヒート マップ。個々の細胞タイプに対する AbSeq 検出の特異性を示しています。


BD® OMICS-One IP タンパク質パネルは柔軟なバックボーン パネルであり、追加の AbSeq 特異性に対応します。3 つの BD® AbSeq 抗体を追加し、再構成した BD® OMICS-One IP タンパク質パネル ペレットと混合しました (n = 2)。
A. BD® OMICS-One IP タンパク質パネルのパフォーマンスは、高い相関関係(ドロップインの有無にかかわらず R2 が 0.99 以上)によって示されるように、ドロップインの影響を受けませんでした。
B. BD® OMICS-One IP タンパク質パネルの CD8 (SK1) および CD45RA (上段) の特異性を、ドロップイン CD8 [RPA-T8]、CD45RO、および CD38 (下段) の特異性と比較して評価し、UMAP に表示しています。CD38 のドロップインでは、CD38 陽性であると予想される細胞タイプが検出されました。CD8 のドロップイン クローン (RPA-T8) は、BD® OMICS-One IP タンパク質パネル クローン (SK1) と非常によく似た染色パターンを示しており、ドロップイン抗体の高い特異性と、同じ抗原に対する 2 つのクローンの互換性を示唆しています。CD45RO (ドロップイン) と CD45RA (BD® OMICS-One IP タンパク質パネル) の対照的な発現パターンは、BD® OMICS-One IP タンパク質パネルに AbSeq 特異性を追加しても実験結果に悪影響がないことを更に裏付けています。


BD® OMICS-One IPタンパク質パネルは、RNAおよびマルチプレックスアッセイで使用できるように設計されています。
A. BD® OMICS-One IP Protein Panel で染色した細胞 (休止期 PBMC と活性化 PBMC の 1:1 混合) から WTA および AbSeq ライブラリを生成し、シーケンスしました。マルチオミクス解析の威力を示すために、WTA データのみ (mRNA 解析) を解析し、WTA + AbSeq データ (mRNA およびタンパク質解析) と比較しました。左側には WTA (mRNA) データのみを使用した UMAP 座標と偏りのないクラスタリング (Phenograph) が表示され、右側には WTA + AbSeq (mRNA およびタンパク質) データを使用した座標と注釈が表示されます。マルチオミクス アプローチにより、追加の細胞タイプが明らかになり、より深い生物学的洞察がもたらされました。
B. BD® シングルセル マルチプレックス キット (SMK) と BD® OMICS-One IP タンパク質パネルの互換性をテストするために、SMK と BD® OMICS-One IP タンパク質パネルを一緒に使用して細胞染色を行い、シーケンス用の WTA、AbSeq、および SMK ライブラリを生成しました。次に、BD® OMICS-One IP タンパク質パネルのマーカーの発現を、SMK なしで生成されたデータと比較しました。これらのデータから、BD® OMICS-One IP タンパク質パネル + WTA と BD® OMICS-One IP タンパク質パネル + WTA + SMK の間に高い相関 (R2 >0.99) が見られ、SMK を追加しても BD® OMICS-One IP タンパク質パネルに影響がないことが示されました。



研究用です。本製品は、疾病の診断・治療または予防に使用することはできません。