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Overview

BDRhapsody™シングルセル解析システムには、BD Rhapsody™スキャナーとBD Rhapsody™Expressシングルセル解析システムが含まれています。

BD Rhapsody™Express シングルセル解析システムは、独自の細胞に優しいマイクロウェル単離技術を用いて数百から数千ものシングルセルをキャプチャーしバーコード化することでゲノム及びプロテオミクス解析を可能にします。

BD Rhapsody™ Scannerを使用して、シングルセルに単離するための各実健ステップを確認しながら慎重に失敗のないシングルセル解析をしていただけます。貴重なサンプルをご使用になる場合や、どれくらいのデータ量を取ればよいかまたシークエンスに進むかどうかの判断材料としてご使用いただけます。

 
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BD Rhapsody™スキャナーは、シングルセル化の各ステップを確認できる機能のついた可視化ツールです

The BD Rhapsody™ Scanner:

  • BD Rhapsody™カートリッジの光学的に透明なトップカバーを通して、カートリッジと各マイクロウェルを確認することができます
  • 細胞キャプチャー率やマルチプレット率など、細胞調製に問題がないかどうか、カートリッジを直接イメージングして確認することができますこのQCステップにより、シークエンスに進むかどうかの判断材料としてご使用いただけます

  • シングルセル化する際のトラブルシューティングに有用で、また細胞数を見積ることができるので、シーケンシングでどれくらいのデータ量をとればよいかの指標にもなります
Analysis
Number of wells with viable cells at cell load 9118
Cell multiplet rate at cell load 2.4%
Number of wells with viable cells and a bead 7999
Cell multiplet rate 2.0%
Bead loading efficiency
PASS
Cell retention rate
PASS
Bead retrieval efficiency
PASS
Excess bead rate
PASS

 

 

 

PERFORMANCE

BD Rhapsody™シングルセル解析システムは、信頼性と再現性のある結果を提供し、トランスレーショナル・リサーチに理想的なシステムです

APPLICATIONS

BD Rhapsody™シングルセル解析システムは表面タンパク質とmRNA発現を同時測定することで、制御性T細胞の異なるサブセットの識別を可能にします

CD45RAおよびHLA-DRでソートされたTregサンプルの手動ゲーティングおよび二変量解析に基づいて特定された3つの主要なTregサブセットに対し、差次的遺伝子発現および差次的タンパク質発現解析をした。遺伝子発現解析には、BD Rhapsody™Targeted Human Immune Response Panel(399遺伝子)を使用した。高発現した遺伝子(>1.25X)はヒートマップに示されている。

BD®AbSeqオリゴ・コンジュゲート抗体を使用して、22種類のタンパク質発現も同時に解析された。

 
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The BD Rhapsody™ シングルセル解析システムを用いた疲弊T細胞の特性評価

CD8 + T細胞への慢性的刺激の14日目に有意義に高発現した12種のタンパクおよび遺伝子発現を示すヒートマップ。2つの細胞集団(赤と緑のボックス)が確認された。

CD38, CD39 , CD94において共発現が認められた。

 
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BD Rhapsody™シングルセル解析システムで、自然リンパ球の不均一性を解明

シングルセルレベルでのタンパク質および遺伝子発現の差異を示すヒートマップ。主要なILCサブセットに不均一性が示されている。

 
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BD Rhapsody™シングルセル解析システムでCLLサンプル内の不均一性を特定

mRNAとタンパク質の同時解析により詳細な細胞集団クラスターが示されている。健康なドナーからのサンプル間でも同様なクラスターが示され、CLLサンプルではそれぞれに特有なクラスターが確認された。

 
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RESOURCES

For Research Use Only. Not for use in diagnostic or therapeutic procedures. 

Results shown are not guaranteed and may not be representative.

Dynabeads is a trademark of Thermo Fisher Scientific.

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