
-
抗体試薬
- フローサイトメトリー用試薬
-
ウェスタンブロッティング抗体試薬
- イムノアッセイ試薬
-
シングルセル試薬
- BD® AbSeq Assay
- BD Rhapsody™ Accessory Kits
- BD® OMICS-One Immune Profiler Protein Panel
- BD® Single-Cell Multiplexing Kit
- BD Rhapsody™ TCR/BCR Next Multiomic Assays
- BD Rhapsody™ Targeted mRNA Kits
- BD Rhapsody™ Whole Transcriptome Analysis (WTA) Amplification Kit
- BD® OMICS-Guard Sample Preservation Buffer
- BD Rhapsody™ ATAC-Seq Assays
- BD® OMICS-One Protein Panels
-
細胞機能評価のための試薬
-
顕微鏡・イメージング用試薬
-
細胞調製・分離試薬
-
- BD® AbSeq Assay
- BD Rhapsody™ Accessory Kits
- BD® OMICS-One Immune Profiler Protein Panel
- BD® Single-Cell Multiplexing Kit
- BD Rhapsody™ TCR/BCR Next Multiomic Assays
- BD Rhapsody™ Targeted mRNA Kits
- BD Rhapsody™ Whole Transcriptome Analysis (WTA) Amplification Kit
- BD® OMICS-Guard Sample Preservation Buffer
- BD Rhapsody™ ATAC-Seq Assays
- BD® OMICS-One Protein Panels
- Japan (Japanese)
-
Change country/language
Old Browser
Looks like you're visiting us from United States.
Would you like to stay on the current country site or be switched to your country?
Overview
免疫システムの複雑さを理解することは、健康と病気における免疫細胞の役割を解明するために不可欠です。これには、適応免疫の重要な決定要因であるT細胞受容体とB細胞受容体(TCRとBCR)のプロファイリングが必要です。次世代のBD Rhapsody™ TCR/BCR Next Multiomic Assayは、シングルセル遺伝子およびタンパク質発現の同時解析とともに、優れた感度で免疫レパートリーを明らかにします。


Features
BDの新しいEnhanced Cell Capture Beads V3で検証されたBD Rhapsody™ TCR/BCR Next Multiomic Assaysは、ヒトとマウスにおいて堅牢なワークフローで全長TCR/BCRレパートリーの高感度分析を可能にします。
主な機能は次のとおりです。
- 優れた全長TCRおよびBCRペアリングメトリクス
- マルチオミクスにより、同じ細胞内でタンパク質と遺伝子発現の解析と同時に免疫プロファイリングが可能
- BD® OMICS-Guard Sample Preservation Bufferで保存した細胞との互換性
- サンプルの生物学的特徴について偏りのない洞察を提供する直感的なデータ分析パイプライン

Applications
シングルセルの全トランスクリプトームまたはターゲットmRNA発現およびタンパク質発現解析と並行して、T細胞およびB細胞のクロノタイプを高感度で識別および解析する単一のワークフロー
このスタディでは、BD® AbSeq Immune Discovery Panelを使用して、主要なPBMCでTCR、BCR、全トランスクリプトーム遺伝子発現、および細胞表面タンパク質を同時に解析しました。合計で6,798個の推定細胞(7,292個の細胞インプット)から 2,380個の完全な表現型が検出されました。
Step 1:
タンパク質と遺伝子の両方の発現データを使用してUMAPプロットを生成し、タンパク質マーカーを使用して細胞集団を識別しました。



Step 2:
CD8+細胞に対して教師なしの分析(フェノグラフ)を実行し、11個のクラスターが特定されました。



Step 3:
CD8+内のユニークなクロノタイプの頻度が報告されました。



Step 4:
上位5つのクロノタイプがUMAPプロットに重ね合わされ、フェノグラフ クラスター内で識別されました。



Step 5:
WTAとAbSeqの情報を使用して、最も頻度の高いクロノタイプを持つ細胞と残りの集団の細胞との差次的遺伝子およびタンパク質発現解析を実行しました。



Step 6:
パイプライン出力ファイルから細胞IDとチェーン情報が取得され、対象のクロノタイプのVDJおよびC 遺伝子情報が決定されました。
Cell Index | TCR Alpha Gamma V gene dominant | TCR Alpha Gamma J gene dominant | TCR Alpha Gamma CDR3 translation dominant | TCR Beta Delta V gene dominant | TCR Beta Delta D gene dominant | TCR Beta Delta J gene dominant | TCR Beta Delta C gene dominant | TCR Beta Delta CDR3 translation dominant | TCR Paired Chains | Cell type experimental | High quality cell |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
236563 | TRAV41*01 | TRAJ49*01 | AVRSGGDTGNQFY | TRBV5‑6*01 | TRBD2*02 | TRBJ2‑1*01 | TRBC2 | ASSLREYNEQF | TRUE | T_CD8_naive | TRUE |
638393 | TRAV41*01 | TRAJ49*01 | AVRSGGDTGNQFY | TRBV5‑6*01 | TRBD2*02 | TRBJ2‑1*01 | TRBC2 | ASSLREYNEQF | TRUE | T_CD8_naive | TRUE |
1789392 | TRAV41*01 | TRAJ49*01 | AVRSGGDTGNQFY | TRBV5‑6*01 | TRBD2*02 | TRBJ2‑1*01 | TRBC2 | ASSLREYNEQF | TRUE | T_CD8_naive | TRUE |
2461787 | TRAV41*01 | TRAJ49*01 | AVRSGGDTGNQFY | TRBV5‑6*01 | TRBD2*02 | TRBJ2‑1*01 | TRBC2 | ASSLREYNEQF | TRUE | T_CD8_naive | TRUE |

Step 7:
パイプライン出力から、クロノタイプの全長配列が取得されました(ヌクレオチド配列も利用可能)。
Cell Index | VDJ Translation Trimmed |
---|---|
236563 | KNEVEQSPQNLTAQEGEFITINCSYSVGISALHWLQQHPGGGIVSLFMLSSGKKKHGRLIATINIQEKHSSLHITASHPRDSAVYICAVRSGGDTGNQFYFGTGTSLTVIP |
236563 | DAGVTQSPTHLIKTRGQQVTLRCSPKSGHDTVSWYQQALGQGPQFIFQYYEEEERQRGNFPDRFSGHQFPNYSSELNVNALLLGDSALYLCASSLREYNEQFFGPGTRLTVL |
638393 | KNEVEQSPQNLTAQEGEFITINCSYSVGISALHWLQQHPGGGIVSLFMLSSGKKKHGRLIATINIQEKHSSLHITASHPRDSAVYICAVRSGGDTGNQFYFGTGTSLTVIP |
638393 | DAGVTQSPTHLIKTRGQQVTLRCSPKSGHDTVSWYQQALGQGPQFIFQYYEEEERQRGNFPDRFSGHQFPNYSSELNVNALLLGDSALYLCASSLREYNEQFFGPGTRLTVL |
1789392 | KNEVEQSPQNLTAQEGEFITINCSYSVGISALHWLQQHPGGGIVSLFMLSSGKKKHGRLIATINIQEKHSSLHITASHPRDSAVYICAVRSGGDTGNQFYFGTGTSLTVIP |
1789392 | DAGVTQSPTHLIKTRGQQVTLRCSPKSGHDTVSWYQQALGQGPQFIFQYYEEEERQRGNFPDRFSGHQFPNYSSELNVNALLLGDSALYLCASSLREYNEQFFGPGTRLTVL |
2461787 | KNEVEQSPQNLTAQEGEFITINCSYSVGISALHWLQQHPGGGIVSLFMLSSGKKKHGRLIATINIQEKHSSLHITASHPRDSAVYICAVRSGGDTGNQFYFGTGTSLTVIP |
2461787 | DAGVTQSPTHLIKTRGQQVTLRCSPKSGHDTVSWYQQALGQGPQFIFQYYEEEERQRGNFPDRFSGHQFPNYSSELNVNALLLGDSALYLCASSLREYNEQFFGPGTRLTVL |
TCR_alpha | KNEVEQSPQNLTAQEGEFITINCSYSVGISALHWLQQHPGGGIVSLFMLSSGK KKHGRLIATINIQEKHSSLHITASHPRDSAVYICAVRSGGDTGNQFYFGTGTSLTVIP |
TCR_beta | DAGVTQSPTHLIKTRGQQVTLRCSPKSGHDTVSWYQQALGQGPQFIFQYYEEEERQRGNFPDRFSGHQFPNYSSELNVNALLLGDSALYLCASSLREYNEQFFGPGTRLTVL |
-
Brochure
-
Protocols (Human)
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next and Targeted mRNA Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next, Targeted mRNA, and Sample Tag Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next, Targeted mRNA, and BD® AbSeq Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next, Targeted mRNA, BD® AbSeq, and Sample Tag Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next and mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA) Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next, mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA), and Sample Tag Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next, mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA), and BD® AbSeq Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System TCR/BCR Next, mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA), BD® AbSeq, and Sample Tag Protocol
-
Protocols (Mouse)
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next and Targeted mRNA Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next, Targeted mRNA, and Sample Tag Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next, Targeted mRNA, and BD® AbSeq Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next, Targeted mRNA, BD® AbSeq, and Sample Tag Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next and mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA) Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next, mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA), and BD® AbSeq Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next, mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA), and Sample Tag Library Preparation Protocol
-
BD Rhapsody™ System Mouse TCR/BCR Next, mRNA Whole Transcriptome Analysis (WTA), BD® AbSeq, and Sample Tag Protocol
研究用です。本製品は、疾病の診断・治療または予防に使用することはできません。