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BD Cellismo™ Data Visualization Tool은 single-cell multiomics 데이터의 2차 분석 및 시각화를 위한 소프트웨어 도구입니다. 연구원들은 코드를 한 줄도 작성하지 않고도 수백만 개의 데이터 포인트를 실행 가능한 인사이트로 전환할 수 있습니다.
BD Cellismo™ 데이터 시각화 도구를 사용하면 다양한 매개변수에 걸쳐 샘플의 데이터를 쉽게 시각화할 수 있습니다. 유전자 발현에 기초한 집단으로 세포를 부분 집합; 히스토그램, 히트맵, dot plots, volcano plots, violin plots, tSNE 및 UMAP 플롯을 생성합니다. 플롯을 사용자 정의하고 내보낼 수 있습니다. PNG 또는 협업 및 출판을 위한 SVG 파일 BD Rhapsody™ Sequence Analysis Pipeline을 사용한 1차 분석과 2차 분석을 모두 사용하여 데이터를 분석하는 방법을 보려면 동영상을 시청하십시오.
기능
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직관적 —가리키고 클릭(Point & Click)하여 데이터를 그래프와 도표로 시각화합니다.
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사용자 친화적 – 비용이 들지 않습니다. 코딩이 필요하지 않습니다.
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Multiomics 지원 —단일 세포 RNA + 단백질 데이터 세트를 쉽게 탐색 가능
코드를 작성하거나 프로그래밍하지 않고도 BD Cellismo™ Data Visualization Tool을 사용하여 Seurat와 동일한 데이터 시각화를 생성합니다.
BD Cellismo™ 데이터 시각화 도구(오른쪽)를 사용하면 코드를 작성하지 않고도 Seurat(왼쪽)와 동일한 데이터 시각화를 생성할 수 있습니다. BD Cellismo™ 데이터 시각화 도구의 인터페이스를 사용하면 포인트 앤 클릭 (Point & Click) 방식으로 그림(예: 도트 크기, 색상, 불투명도)을 쉽게 사용자 지정할 수 있습니다.
입력 요구 사항 :
- (선호) BD Rhapsody™ Sequence Analysis Pipeline. 의 Cellismo 출력 파일. 이 파일에는 파이프라인에 의해 생성된 세포 주석(예: Sample Multiplexing Tag, Immune Cell Type) 외에도 모든 양식(RNA 및 AbSeq)에 대한 발현 데이터가 포함되어 있습니다.
- 대체 입력 형식: :
- Market exchange (MEX)
- H5MU/H5AD
초기 릴리스 기능
최신 버전: v1.0 | 릴리스 날짜: 2025년 2월
초기 릴리스에는 다음과 같은 기능이 포함되어 있습니다.
- BD Rhapsody™ Sequence Analysis Pipeline을 포함한 여러 형식에서 single-cell multiomic data 를 로드합니다. 번들 메타데이터가 있는 Cellismo 파일, matrix market MEX, Scanpy/Muon 또는 H5MU/H5AD
- 여러 개의 단일 셀 프로젝트를 관리하고 몇 번의 클릭만으로 프로젝트 사이를 이동할 수 있습니다.
- 어떤 세포가 제거되고 있는지 시각적으로 보여주는 품질 관리
- 7가지 유형의 그래프를 생성합니다: 차원 축소 산란, 이축, 바이오product 상관 관계, 히트맵(Heatmap), 도트 플롯(Dot plot), 히스토그램 및 바이올린(Violin).
- 스타일 옵션을 통한 광범위한 그래프 사용자 정의
- 프로젝트 갤러리 사이드바(Project Gallery Sidebar)에 이미지를 저장하고 쉽게 불러올 수 있습니다.
- 사이드바에서 외부 애플리케이션으로 갤러리 이미지 드래그
- 관심 있는 셀을 순환시키거나, Leiden 또는 K-means 클러스터링을 실행하거나, 기존 주석을 결합하여 새 셀 주석을 생성합니다
- 관심 세포 그룹 간의 차등 발현을 분석합니다. 테이블에서 관심 유전자를 필터링하고 화산 플롯(volcano plot)에서 보기
- 새로운 차원에서의 축소 좌표 생성
- Whole transcriptome 또는 targeted RNA, AbSeq/CITE-seq를 통한 protein counts및 sample multiplexing 지원
시스템 요구 사항
- Windows 10 이상(64비트)
- MacOS 11(Big Sur) 이상
- Intel 또는 Apple 실리콘 칩
- 최소 8GB RAM
- 16GB RAM(200,000개 셀)
- 64M 셀용 1GB RAM
무료이지만 강력함 - 직접 사용해 보세요
지금 무료 BD Cellismo™ 데이터 시각화 도구를 다운로드하십시오. 정보를 제공하고 제출을 클릭하면 다운로드가 자동으로 시작됩니다. 당사는 귀하의 정보를 사용하여 최신 개발, 업데이트 및 버그 수정이 제공되는 대로 최신 정보를 계속 업데이트할 것입니다.
Windows 사용자:
파일이 다운로드되면 .exe 파일을 두 번 클릭합니다. 설치되는 동안 간단한 애니메이션이 표시됩니다. 설치가 완료되면 프로그램이 자동으로 열립니다. 바탕 화면에 바로 가기가 배치됩니다.
Mac 사용자:
칩 아키텍처에 따라 Mac(Intel) 또는 Mac(Apple M)의 두 가지 설치 패키지가 있습니다. 칩 아키텍처를 확인하려면 왼쪽 상단의 Apple 메뉴를 누릅니다. 이 Mac에 관하여를 선택합니다. Chip이라고 표시된 곳에 Intel 또는 Apple이라고 표시되어야 합니다. 아래 양식에서 시스템에 적용되는 옵션을 선택하십시오. 파일이 다운로드되면 .zip 파일을 두 번
클릭하여 압축을 풉니다 Cellismo.app. Cellismo.app 두 번 클릭하여 엽니다. 앱을 원하는 폴더(예: 사용자의 Applications 디렉터리)로 이동할 수 있습니다.
설치가 완료되면 홈 페이지의 Start New Project(새 프로젝트 시작) 탭에서 새 프로젝트를 시작합니다. 데이터 파일을 페이지로 끌어다 놓고 Start Analysis(분석 시작)를 클릭합니다..
Download the Free BD Cellismo™ Tool
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Apple 및 Mac은 Apple, Inc.의 상표이며 Illumina는 Illumina, Inc.의 상표입니다. Intel은 Intel Corporation 또는 그 자회사의 상표입니다.
연구용으로만 사용할 수 있습니다. 진단 또는 치료 절차에 사용하지 마십시오.