BD^® Single-Cell Multiplexing Kit

Single-cell RNA sequencing을 위한 sample의 multiplexing을 위해 개별 cell의 sample 특이적인 tagging이 가능합니다.

개요

BD^® Single-Cell Multiplexing Kits (human및 mouse)는 BD Rhapsody™ Cartridge에서 최대 12개의 서로 다른 sample을 동시에 처리할 수 있도록 해줍니다. 이 kit는 모든 BD Rhapsody™ Assay와 함께 사용할 수 있으며 자동으로 Sample Tag을 demultiplex하고 데이터를 분석하는 동안 BD Rhapsody™ Bioinformatics Pipeline에 있는 informatics tool을 이용하여 개별 sample을 확인할 수 있습니다.

BD^® Single-Cell Multiplexing Kit brochure에서 상세 정보를 확인해 보세요.

특징

The BD^® Single-Cell Multiplexing Kit:

BD Rhapsody™ Cartridge 당 최대 24개의 다른 sample을 multiplexing 하여 실험 비용을 낮출 수 있습니다.
항체 tagging을 최적화하고 informatics tool과 함께 진정한 sample to answer assay를 경험할 수 있습니다.
Sample tagging을 통해 별개의 sample에서 발생하는 cell multiplet에 의한 오류를 식별하고 제거할 수 있도록 하여 데이터 품질을 향상시킵니다.
Human 및 mouse sample에서 사용할 수 있도록 만들어졌습니다.

성능

BD^® Single-Cell Multiplexing Kit 은 cell multiplet들을 구별하여 고퀄리티 결과를 내줍니다.

BD^® Single-Cell Multiplexing Kit와 BD Rhapsody™ Human Immune Response Panel을 이용한 single-cell gene expression profile의 t-SNE 분석 결과입니다. A. BD Rhapsody™ Bioinformatics Pipeline 을 이용하여 Sample Tag determination algorithm annotation에 따라 cell 의 색이 구분되었습니다. B. Blue cell은 식별된 multiplet을 나타냅니다. C. 분석을 위한 더 깨끗한 데이터를 얻기 위해 multiplet과 미확인 cell이 있는 t-SNE plot은 제거했습니다.

적용

BD^® Single-Cell Multiplexing Kit 는 unidentified multiplet 을 최소화한 상태에서 로딩 및 분석되는 cell 수를 증가시키기 위해 사용될 수 있습니다.

Immune Response Panel을 이용하여 12개 sample에서 BD Rhapsody™ System으로 cell cluster t-SNE 시각화 A. Marker로 식별된 주요 cell type annotation. Cluster 사이에 multiplet으로 추정되는 cluster가 존재하며 이중 다수는 Sample Tag를 이용하여 확인되었습니다. B. Sample Tag로 확인된 multiplet 강조 표시: 하나의 cell type cluster 내에서도 Sample Tag를 사용하여 multiplet을 식별할 수 있습니다. C. Sample Tag로 확인된 multiplet과 관련된 cluster를 제거하면 보다 깨끗한 single-cell RNA sequencing 데이터를 얻을 수 있습니다.

BD^® Single-Cell Multiplexing Kit 은 multiplet을 확인하기 위해 single-cell suspension sample과 함께 사용할 수 있습니다.

12개의 Sample Tag 실험에서 Jurkat-only cluster(Sample Tag 4-6) 시각화. A. Multiplet은 Jurkat cluster 내에서 파란색 점으로 표시했습니다. 많은 Jurkat multiplet은 cluster 왼쪽 상단에 위치하는 것을 확인할 수 있습니다. B. Jurkat cluster에서 확인된 왼쪽 상단에서 추정되는 cell는 cell 당 유전자 검출이 많이 된 것과 관련이 있습니다. C. 이렇게 추정되는cell에서 총 mRNA molecule을 추출한 결과, Sample Tag를 이용하여 multiplet으로 정의한 cell에서 molecule detection이 높았기 때문에, 이는 진정한 multiplet임을 시사합니다.