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개요

BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System 에는 BD Rhapsody™ Scanner 와  BD Rhapsody™ Express Single-Cell Analysis System이 포함되어 있습니다. BD Rhapsody™ Express System은 독보적이고 gentle하며 탄탄한 microwell 기반의 single-cell 분리 기술을 이용하여 single-cell capture 및 게놈 및 단백질 정보를 분석을 위한 수백~수천 개의 single-cell 바코딩을 할 수 있습니다. BD Rhapsody™ Scanner는 single-cell capture workflow의 모든 단계를 관찰하고 모든 단계의 분석 지표를 제공하도록 설계되어 사용자가 전체 workflow에 걸쳐 중요한 의사결정을 할 수 있도록 해줍니다.  

 

BD Rhapsody™ 브로셔 에서 더 많은 정보를 확인해 보세요.

 
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특징

BD Rhapsody™ Scanner는 single-cell capture여부를 육안으로 확인할 수 있도록 하며, 모든 단계에서 주요 품질을 평가할 수 있는 지표를 제공합니다.

BD Rhapsody™ Scanner의 특징

  • BD Rhapsody™ Cartridge 의 광학적으로 투명한 window를 통해 cartridge 와 microwell의 육안점검을 가능하게 합니다. 
  • cell 전처리 품질 분석을 위해 cartridge direct imaging을 통한 cell capture rate 및 cell multiplet rates 등 품질관리 수치들을 제공합니다.  품질관리 지표는 workflow 오류발생 여부를 표시하여 여러분이 sequencing 진행 여부를 결정할 수 있도록 도와줍니다.
  • 문제 해결에 유용하게 사용되며 sequencing을 통해 retrieve될 것으로 예상되는 cell 수 추정이 가능합니다.

 

Analysis
Number of wells with viable cells at cell load 9118
Cell multiplet rate at cell load 2.4%
Number of wells with viable cells and a bead 7999
Cell multiplet rate 2.0%
Bead loading efficiency
PASS
Cell retention rate
PASS
Bead retrieval efficiency
PASS
Excess bead rate
PASS

 

 

 

성능

BD Rhapsody™ Single Cell Analysis System은 신뢰할 수 있고 재현 가능한 결과를 제공하여 중개연구에 이상적입니다.

응용분야

BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System은 표면 단백질과 mRNA 발현을 동시에 측정하여 regulatory T-cell의 subset을 분명하게 식별할 수 있도록 합니다.

CD45RA와 HLA-DR로 분류된 Treg 샘플의 manual gating과 bivariate  분석을 바탕으로 도출된 세 개의 주요 Treg subset에 대해 differential gene expression과 differential protein expression analysis를 실시했습니다. BD Rhapsody™ Targeted Human Immune Response Panel (399개 유전자)를 이용하여 differential gene expression 분석을 수행했습니다. 위의 heat map에서 upregulated 유전자(>1.25X)를 표시했습니다. BD® AbSeq Oligo-Conjugated Antibodies를 이용하여 22개 differential protein expression 을 동시에 수행했습니다.

 
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BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System은 exhausted T-cell의 심층 특성분석에 사용할 수 있습니다.

CD8+ T-cell의 chronic simulation에서14일째 상당히 upregulated된 12개 단백질 및 유전자의 발현 모습입니다. Marker의 발현 수준에 따라 두 집단(red와 green box)가 나타났습니다. CD38, CD39, CD94에서 co-expression pattern이 관찰되었습니다.

 
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BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System으로 선천성 림프구 cell heterogeneity의 식별이 가능합니다.  

Single-cell 수준에서의 differential protein과 gene expression. 주요 ILC subsets에서

heterogeneity 가 관찰되었습니다.

 
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BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System은 CLL 샘플 내에서 heterogeneity 식별을 가능하게 합니다.

mRNA와 단백질 동시 분석을 이용하여 cluster를 잘 정의했습니다. 건강한 기증자로부터 획득한 샘플도 유사하게 clustering 됩니다. CLL 샘플은 따로따로 고유하게 clustering 됩니다.

 
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BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System

강력한 high-throughput microwell 기반의 single-cell 분리 시스템으로 실험 중 육안으로 QC를 확인할 수 있는 시스템과 함께 사용할 수 있습니다.
견적요청
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리소스

연구용입니다. 진단용 또는 치료용으로 사용할 수 없습니다.

표시된 결과는 보장되지 않으며, 전체 결과를 대표하지 않을 수 있습니다.

 

Dynabeads는 Thermo Fisher Scientific의 상표입니다.