Spectrum Viewer User Guide and FAQ

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BD® 스펙트럼 뷰어는 유세포분석 형광 비교 및 선택을 지원하는 대화형 온라인 도구입니다. 이 도구를 사용하면 다음을 수행할 수 있습니다:

광범위한 형광 라이브러리의 여기(Ex) 및 방출(Em) 스펙트럼을 분석 및 비교
장비 구성/필터 설정에 맞게 스필오버 감지 및 형광색 선택 최적화
스펙트럼 간의 가시성을 높이기 위해 결합된 Ex/Em 그래프 보기 또는 적층된 Ex/Em 그래프 보기 간 전환
임의의 표준 유세포 분석기에서 방출 프로파일을 시각화 및 분석하거나 BD 스펙트럴 유세포 분석기 구성 선택 및 유사성 및 복잡도 지수 확인
대규모 형광색 조합을 볼 때 특히 유용하도록 고유 히트맵으로 스펙트럼 시그니처의 피크 강도를 시각화
·작업 저장, 내보내기 및/또는 공유

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Standard Configuration Pathway

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장비 선택

그래프 아래의 장비 구성 (Instrument Configuration) 탭 (a)에 있는 드롭다운 목록을 사용하여 사전 구성된 BD 장비 목록에서 선택합니다.
또는 Blue Add Laser & Filters 버튼을 클릭하여 고유한 구성을 설정합니다.
두 가지 방법 중 하나로 고유한 장비 구성을 저장합니다. BD Biosciences 계정에 로그인한 경우 구성 저장 버튼(b)을 클릭하고 나중에 햄버거 메뉴()의 내 저장 항목에서 파일을 찾으십시오. 계정/로그인 없이 햄버거 메뉴()에서 내보내기 및 가져오기 옵션을 사용하세요. 자세한 내용은 아래의 저장 및 공유 지침을 참조하세요.

TIP: 표준 구성을 템플릿으로 시작한 다음 표에서 detectors, 레이저 및 필터를 조정/추가/삭제할 수 있습니다. 재설정하려면 지우기 버튼(c)을 사용하세요.

팁: 구성을 선택하지 않고도 또는 장비 구성 탭의 Add Laser (레이저) & Filter (필터) 버튼을 통해 특정 레이저로 형광색을 시각화할 수 있습니다. 형광색소 추가를 시작하려면 아래의 형광색소 선택 섹션을 참조하세요.

Standard configuration pathway, instrument selection

형광색소 선택

형광색소는 이름, 레이저, 여기 범위 또는 방출 범위별로 추가할 수 있습니다. 하나의 검색 결과 세트에서 여러 형광색소를 선택하거나 계속 검색하고 추가를 클릭하여 추가 형광색소를 추가합니다.
형광색소를 선택한 후 해당 방출 및 여기 곡선이 표시됩니다. 보기를 수정하려면 형광색소 목록에서 Ex 또는 Em을 선택 취소합니다. 여기 또는 방출 곡선 위로 마우스를 가져가면 개별 스펙트럼이 강조 표시됩니다. 또는 형광색 탭의 목록에서 형광색을 선택하여 그래프에서 하나 이상의 형광색을 강조 표시합니다.
두 가지 방법 중 하나로 형광색소 조합을 저장합니다. BD Biosciences 계정에 로그인한 경우 구성 저장 버튼을 클릭하고 나중에 햄버거 메뉴()의 내 저장 항목에서 파일을 찾으세요. 계정/로그인 없이 햄버거 메뉴()에서 내보내기 및 가져오기 옵션을 사용하세요. 자세한 내용은 아래의 저장 및 공유 지침을 참조하세요.
새로운 형광색소가 주기적으로 추가되므로 자주 확인해보세요.

TIP: 형광색소 목록에서 정보 아이콘()을 클릭하여 기본 형광색소 정보를 보고 카탈로그에 액세스합니다.

Standard configuration pathway, fluorochrome selection

시각화 및 조작

그래프 위의 드롭다운 메뉴에서 Stacked Ex/Em Graphs를 선택하여 단일 레이저 스택에서 형광색소를 시각화합니다. 기본 설정은 레이저로 정규화됩니다.
추가 레이저 라인을 보려면 오른쪽의 스크롤 막대를 사용하십시오. 동일한 드롭다운 메뉴를 사용하여 결합된 Ex/Em 그래프로 다시 전환합니다.

Standard configuration pathway, visualization and manipulation

그래프의 특정 영역을 확대하려면 커서(+)를 사용하여 관심 영역을 클릭하고 드래그합니다. 기본 보기로 돌아가려면 그래프 위의 확대/축소 재설정을 클릭하세요.

Standard configuration pathway, visualization and manipulation 2

햄버거 메뉴의 그래프 표시 옵션 (Graph display option)에서 추가 선택이 가능합니다 ().
- 마우스오버 세부정보 활성화
- 방출을 레이저 여기로 정규화
- 대체 색상 구성표
- 배경 그리드 표시
- 형광색소 라벨 표시(라벨을 숨기면 마우스 오버 시 라벨이 표시됨)
- 필터 중복 해결
형광색소 라벨 정보를 보려면 방출 프로필 위에 커서를 올리십시오.
형광색소 탭의 목록에서 선택하여 그래프에서 하나 이상의 형광색소를 강조 표시합니다.

TIP: 햄버거 메뉴()를 클릭하고 내보내기 및 가져오기 섹션을 확장한 후 그래프 옆에 있는 내보내기를 클릭하여 그래프 이미지를 내보낼 수 있습니다. 내보내기 및 가져오기 기능에 대해 자세히 알아보려면 아래의 저장 및 공유 섹션을 참조하세요.

저장 및 공유

스펙트럼 그래프 이미지, 형광색소 조합 및 주문 제작 장비 구성을 저장하고 공유합니다.
- 로그인하지 않고도 형광색소 목록 및 주문 제작 장비 구성을 .csv 파일로 내보내고 가져올 수 있습니다. 이 파일들은 로컬로 저장하거나 공유할 수 있으며 나중에 Import 옵션을 사용하여 가져올 수 있습니다. 스펙트럼 그래프 이미지는 로컬로 저장할 수 있는 다양한 파일 형식으로 다운로드할 수 있습니다.
- BD Biosciences 계정에 로그인한 경우 형광색소 목록과 장비 구성을 계정 내 사용자별 파일로 저장할 수 있습니다. 햄버거 메뉴()의 내 저장 항목 섹션에서 불러올 수 있습니다.

Satandard configuration pathway, save and share

Spectral Configuration Pathway

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장비 선택

스펙트럴 기능은 스펙트럴 유세포 분석기를 선택한 경우에만 사용할 수 있으며 표준 유세포 분석기 또는 사용자 정의 구성을 선택한 경우에는 사용할 수 없습니다.
BD FACSymphony™ A5 SE, BD FACSymphony™ S6 SE 또는 BD FACSDiscover™ S8 Flow Cytometer를 사용한 스펙트럴 유세포 분석 실험의 경우 장비 드롭다운 목록에서 해당 장비를 선택합니다. 스펙트럴 장비는 사용자 지정이 불가능하며 레이저, 필터 및 기타 옵션이 회색으로 표시됩니다. 이 구성을 저장하는 옵션은 없습니다.
기본 보기는 스펙트럼 서명 그래프 (Spectrum Signature Graph)가 됩니다.

TIP: 장비 구성을 선택하지 않고도 또는 장비 구성 탭의 Add Laser (레이저) & Filter (필터) 버튼을 통해 특정 레이저로 형광색을 시각화할 수 있습니다. 형광색소 추가를 시작하려면 아래의 형광색 선택 섹션을 참조하십시오.

형광색소 선택

형광색소는 이름, 레이저, 여기 범위 또는 방출 범위별로 추가할 수 있습니다. 하나의 검색 결과 세트에서 여러 형광색소를 선택하거나 계속 검색하고 추가를 클릭하여 추가 형광색소를 추가합니다.
형광색소를 선택한 후 해당 방출 및 여기 곡선이 표시됩니다. 보기를 수정하려면 형광색소 목록에서 Ex 또는 Em을 선택 취소합니다. 여기 또는 방출 곡선 위로 마우스를 가져가면 개별 스펙트럼이 강조 표시됩니다. 또는 형광색 탭의 목록에서 형광색을 선택하여 그래프에서 하나 이상의 형광색을 강조 표시합니다.
두 가지 방법 중 하나로 형광색소 조합을 저장합니다. BD Biosciences 계정에 로그인한 경우 구성 저장 버튼을 클릭하고 나중에 햄버거 메뉴()의 내 저장 항목에서 파일을 찾으세요. 계정/로그인 없이 햄버거 메뉴()에서 내보내기 및 가져오기 옵션을 사용하세요. 자세한 내용은 아래의 저장 및 공유 지침을 참조하세요.
새로운 형광색소가 주기적으로 추가되므로 자주 확인해보세요. 선택한 형광색 옆에 빨간색 X (insert icon)가 있으면 스펙트럴 시그니처 데이터를 아직 사용할 수 없으며 결합되거나 쌓인 그래프 보기에만 표시할 수 있습니다. 마찬가지로 유사성 및 복잡도 값을 사용할 수 없습니다.

Tip: 형광색소 목록에서 정보 아이콘()을 클릭하여 기본 형광색소 정보를 보고 카탈로그에 액세스합니다..

Spectral pathway, fluorochrome selection

시각화 및 조작

스펙트럴 장비 구성의 기본 보기는 스펙트럴 시그니처 그래프입니다.

그래프 위의 드롭다운 메뉴를 사용하여 다른 보기로 전환합니다. Combined Ex/Em 그래프, Stacked Ex/Em 그래프, 스펙트럼 시그니처 그래프 및 스펙트럴 시그니처 히트 맵의 네 가지 사용 가능한 옵션 중에서 선택할 수 있습니다.
그래프 위의 드롭다운 메뉴에서 Stacked Ex/Em 그래프를 선택하여 단일 레이저 스택에서 형광색소를 시각화합니다. 기본 설정은 레이저로 정규화됩니다. 추가 레이저 라인을 보려면 오른쪽의 스크롤 막대를 사용하십시오. Cobined Ex/Em 그래프를 선택하여 다중 레이저 보기를 볼 수도 있습니다.
스펙트럴 시그니처 히트맵은 스펙트럴 시그니처 그래프에 포함된 동일한 정보를 시각화하는 대체 방법입니다. 히트맵을 통해 사용자는 선택한 모든 형광색소에 대한 스펙트럴 특성을 동시에 시각화 및 식별하고 전체 세트에서 스펙트럴이 겹치는 영역을 평가할 수 있습니다. 히트맵은 더 큰 규모의 형광색소 조합에 가장 유용합니다.

Spectral pathway, visualization and manipulation

스펙트럴 장비 구성을 선택하면 그래프 위에 있는 드롭다운 메뉴 오른쪽에서 유사성 및 복잡도 (Similarity & Complexity) 매트릭스 옵션을 사용할 수 있게 됩니다. 팝업 창에서 매트릭스를 보려면 클릭하세요.

Tip: 팝업 창 오른쪽 하단에 있는 내보내기 버튼을 사용하여 향후 참조를 위해 사용 가능한 파일 형식으로 매트릭스를 내보낼 수 있습니다.

Spectral pathway, similarity and complexity scores

햄버거 메뉴()의 그래프 표시 옵션에서 추가 선택이 가능합니다.
- 마우스오버 세부정보 활성화
- 방출을 레이저 여기로 정규화
- 대체 색상 구성표
- 배경 그리드 표시
형광색소 탭의 목록에서 선택하여 그래프에서 하나 이상의 형광색소를 강조 표시합니다.

저장 및 공유

스펙트럴 그래프 이미지와 형광색소 조합을 저장하고 공유합니다.
- 로그인하지 않고도 형광색소 목록을 .csv 파일로 내보내고 가져올 수 있습니다. 로컬로 저장하거나 공유하고 나중에 가져오기 옵션을 사용하여 가져올 수 있습니다. 스펙트럴 그래프 이미지는 로컬에 저장할 수 있는 다양한 파일 형식으로 다운로드할 수 있습니다.
- BD Biosciences 계정에 로그인한 경우 형광색소 목록을 계정 내 사용자별 파일로 저장할 수 있습니다. 햄버거 메뉴()의 내 저장 항목 섹션에서 불러올 수 있습니다.
- 또한 팝업 창 오른쪽 하단에 있는 내보내기 버튼을 사용하여 향후 참조를 위해 사용 가능한 파일 형식으로 유사성 또는 복잡도 매트릭스를 내보낼 수 있습니다.

Frequently Asked Questions

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스펙트럴 구정 FAQs

BD FACSymphony™ A5 SE 유세포 분석기, BD FACSymphony™ S6 SE 및 BD FACSDiscover™ S8 세포 분류기 데이터는 어떻게 생성되었습니까?

권장 설정 프로토콜을 사용하여 각 장비 플랫폼에서 형광색소 스펙트럴 시그니처를 생성했습니다. 스펙트럴 시그니처는 사용된 유세포 분석기 구성 및 설정에 따라 달라집니다. 따라서 개별 장비의 결과는 여기에 설명된 것과 다를 수 있습니다.

BD FACSymphony™ A5 SE 세포 분석기 및 BD FACSymphony™ S6 SE 세포 분류기 구성을 사용할 때 일부 형광색소에서 예상치 못한 스펙트럴 특성이 나타나는 이유는 무엇입니까?

특정 염료를 평가할 때 예상치 못한 모양이나 피크 레이저/검출기 또는 다른 스펙트럴 뷰어와 비교하여 스펙트럴 특성의 차이를 발견할 수 있습니다. 여기에는 여러 가지 이유가 있을 수 있습니다:

측정된 스펙트럴 시그니처는 염료의 여기 및 방출 곡선뿐만 아니라 유세포 분석기의 각 레이저 출력, 각 검출기에 사용되는 특정 필터 밴드 및 검출기 voltage 또는 gain 선택의 함수입니다. 이것은 장비가 기존 장비인지 스펙트럴 장비인지에 관계없이 항상 true값이지만 스펙트럴 장비를 사용하면 더욱 분명해집니다.

BD FACSymphony™ A5 SE 세포 분석기와 BD FACSymphony™ S6 SE 세포 분리기의 스펙트럴 필터 대역은 스펙트럼을 균등하게 분할하지 않고 스펙트럼의 다른 부분을 채우면서 일반적으로 사용되는 형광에 대한 기존 “피크” 필터의 서브세트를 포함하도록 설계되었습니다.

Tandem 형광 제품을 사용하면 예상치 못한 시그니처가 관찰되는 경우가 많습니다. Tandem 형광은 tandem donor와 acceptor가 서로 다른 레이저에 의해 excitation될 수 있습니다. Acceptor를 excitation 시키는 레이저가 donor를 excitation 시키는 레이저보다 더 높은 출력을 갖는 경우 acceptor excitation 레이저의 시그널이 더 높을 가능성이 있을 것으로 예상됩니다

스펙트럴 시그니처가 예상과 다르게 보이더라도 유사성 지수와 같은 스펙트럴 패널 성능과 관련된 지수가 BD FACSymphony™ S6 SE 세포 분리기 장비 사이에서 일관성을 보인다는 것을 확인했습니다.

Resources

패널 디자인 Interactive Human Cell Map Clone Comparison Tool Lasers and Dyes FlowJo™ Software