Système d’analyse de cellules individuelles BD Rhapsody™ Express

Un puissant système de séparation des cellules à l’échelle unique, basé sur des micropuits

Vue d’ensemble

présentation

Le système BD Rhapsody™ Express permet la capture et le marquage par code-barres de centaines ou milliers de cellules uniques pour l'analyse des informations génomiques et protéomiques, à l'aide d'une technologie brevetée, sensible et robuste de séparation des cellules individuelles à base de micropuits. Le système BD Rhapsody™ Express peut être utilisé pour des expériences à plus petite échelle ou pour des besoins de débit plus faible par rapport au NOUVEAU système BD Rhapsody™ HT Xpress, notre NOUVELLE plateforme pour une conception expérimentale flexible et évolutive et des nombres de cellules et d'échantillons à plus haut débit. Le système BD Rhapsody™ Express est également idéal pour une utilisation de routine avec des systèmes cellulaires familiers qui ne nécessitent pas de contrôle visuel ou d’investigation.

Pour plus d'informations, consultez la brochure BD Rhapsody™ Express System.

CARACTÉRISTIQUES

Le système BD Rhapsody™ Express permet une séparation puissante de cellules à l’échelle individuelle par micropuits

Ensemble minimal d'équipements de paillasse, pas de pompes fluidiques
Permet un traitement en douceur des cellules lorsqu'elles se déposent dans les micropuits par gravité
Chaque cartouche BD Rhapsody™ Single-Lane Cartridge contient un réseau de micropuits avec >220 000 compartiments
La cartouche BD Rhapsody™ Single-Lane a un volume de ~600 µL ; les suspensions cellulaires diluées peuvent être chargées directement dans la cartouche sans qu'il soit nécessaire de les concentrer dans de très petits volumes
Aucun canal microfluidique n'est impliqué, de sorte que le bouchage des canaux par des cellules est moins préoccupant
Les micropuits sont spécialement traités pour empêcher les cellules d'adhérer aux surfaces et un contrôle qualité approfondi est effectué

High correlation in gene expression and minimal batch effects seen in data obtained from beads stored up to 12 weeks.

Les billes magnétiques stables barre-codées utilisées avec le système BD Rhapsody™ peuvent être conservées pour des expériences ultérieures, ce qui permet une certaine souplesse dans la conception des expériences

Les billes de capture cellulaire améliorée BD Rhapsody™ restent intactes tout au long du protocole
Les billes contenant des molécules d'ADNc peuvent être conservées pendant plusieurs mois
Les billes peuvent être sous-échantillonnées pour la création de plusieurs bibliothèques de séquençage
Les billes archivées peuvent être regroupées et séquencées ensemble pour une meilleure efficacité opérationnelle
Les billes archivées peuvent être facilement partagées avec des partenaires de recherche
Les billes archivées et sous-échantillonnées peuvent contribuer à la normalisation des performances et à l'élaboration de procédures opératoires normalisées

Corrélation élevée dans l'expression des gènes et effets de lot minimes observés dans les données obtenues à partir de billes stockées jusqu'à 12 semaines.

High correlation in gene expression seen between technical and biological replicates and between users and sites.

Le système BD Rhapsody™ Express est le choix idéal pour les études translationnelles, multicentriques et multicohortes

Résultats fiables et reproductibles d'une séparation de cellules individuelles sensible et basée sur la gravité sans microfluidique

Effets de lot minimes avec réplicats techniques
Effets de lot minimes avec réplicats biologiques
Variabilité minimale d'un site à l'autre
Variabilité minimale entre utilisateurs
Biais minimal de l'échantillon
Capacité d'intégrer de grands ensembles de données sans correction des effets de lot

Forte corrélation dans l'expression des gènes entre les réplicats techniques et biologiques et entre les utilisateurs et les sites.

Performance

Le système d'analyse cellulaire BD Rhapsody™ fournit des résultats fiables et reproductibles, ce qui en fait un système idéal pour les études translationnelles

Le système offre des taux de capture de cellules supérieurs et des taux de multiplets faibles avec une variété de types de cellules, par rapport à d'autres systèmes.

La forte corrélation de tous les marqueurs d'ARNm et de protéines permet d'identifier des populations de cellules T similaires d'une cartouche à l'autre

Données équivalentes provenant de réplicats biologiques

Données équivalentes à partir de sous-échantillons de billes

Des proportions similaires de chaque type de cellule sont récupérées à partir des analyses WTA et ciblée sur des sous-échantillons de billes.

Applications

Le système BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis permet de mesurer simultanément les protéines de surface et l'expression de l'ARNm, ce qui facilite l'identification de sous-ensembles distincts de cellules T régulatrices

L'analyse de l'expression génique différentielle et de l'expression protéique différentielle a été réalisée sur trois sous-ensembles principaux de Treg identifiés sur la base d'un fenêtrage manuel et d'une analyse bivariée d'échantillons de Treg triés selon les critères CD45RA et HLA-DR. L'analyse de l'expression génique différentielle a été réalisée à l'aide du panel BD Rhapsody™ Targeted Human Immune Response Panel (399 gènes). Les gènes régulés à la hausse (>1,25X) sont indiqués dans la carte thermique ci-contre. L'expression protéique différentielle de 22 protéines a été réalisée simultanément à l'aide des anticorps oligo-conjugués BD® AbSeq.

Le système BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis peut être utilisé pour la caractérisation approfondie des cellules T épuisées

Expression de 12 protéines et gènes significativement régulés à la hausse au jour 14 de la simulation chronique des cellules T CD8+. Deux populations (cadres rouge et vert) sont apparues en fonction du niveau d'expression des marqueurs. Des modèles de co-expression ont été discernés pour CD38, CD39 et CD94.

Le système BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis permet d’interroger l'hétérogénéité des cellules lymphoïdes innées

Expression différentielle des protéines et des gènes au niveau de la cellule unique. L'hétérogénéité a été observée dans les principaux sous-ensembles ILC.

Le système BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis permet d'identifier l'hétérogénéité au sein des échantillons de LLC

Les clusters sont bien définis grâce à l'analyse simultanée de l'ARNm et des protéines. Les échantillons provenant de donneurs sains se regroupent de manière similaire. Les échantillons de LLC se regroupent de manière distincte et unique.